A história se passa no ano de 2123, quando a humanidade chegou à beira da extinção e tudo mudou. Agora com novos eventos acontecendo pelo mundo, um novo Projeto é criado como uma arma biológica capaz de mudar de uma vez o futuro da humanidade. Kenny desperta dentro de uma instalação secreta e de alta tecnologia, sem saber quem ele é e o que está acontecendo no local. O garoto terá que buscar respostas sobre a sua própria existência enquanto enfrenta legiões de inimigos que tentarão de qualquer forma capturá-lo e aprisioná-lo de volta. Com a ajuda de um Elemental misterioso, Kenny corre contra o tempo, libertando outros Elementais que podem ajudá-lo a escapar da instalação, antes que o cientista que o criou revele seus verdadeiros objetivos.